Con la unificación del sistema de salud en el Departamento de Itapúa, se estableció un Plan de contingencia conformado para reforzar el sistema de salud tanto a nivel local como departamental.

Conforme a lo dispuesto en el Plan de contingencia de Salud en el departamento de Itapúa, las atenciones son focalizadas y distribuidas en 3 centros asistenciales:

Hospital Pediátrico Municipal de Encarnación: atención a pacientes pediátricos con enfermedades no respiratorias (menores de 15 años).

Instituto de Previsión Social: centro de atención a pacientes con cuadros respiratorios, ya sean adultos, niños y niñas hasta 14 años (incluso no asegurados).

Hospital Regional de Encarnación: casos de ginecología y obstetricia, neonatología, traumatología, y clínica médica.

Contar con un sistema unificado de salud garantiza el acceso universal, equitativo y oportuno a la atención integral de la salud a toda la ciudadanía.