El Hospital Pediátrico Municipal de Encarnación, cuenta con un vacunatorio que cumple con todos los requerimientos del Programa Nacional de Enfermedades Inmunoprevenibles y PAI, conocido como Programa Ampliado de Inmunizaciones (PAI), dependiente del Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social del Paraguay. Su horario de atención es de lunes a viernes de 7 a 18 horas.

Las vacunas con las que cuenta el vacunatorio son:
• 1 año: SÓLO LOS JUEVES contra la fiebre amarilla
• 2 meses: Rotavirus, IPV, PENTA
• 4 meses: Rotavirus, IPV, Penta
• 6 meses: IPV y Penta
• 15 meses: VVZ (Varicela) – VHA (Hepatitis A)
• 18 meses: BOPV (Poliomielitis) y DPT (Fiebre amarilla)
• 4 años: BOPV (Poliomielitis). SPR. DPT (Fiebre amarilla).
• 5 años: Refuerzo VVZ (Varicela)

Las vacunas ayudan a proteger contra muchas enfermedades que solían ser mucho más comunes. Los ejemplos incluyen tétanos, difteria, paperas, sarampión, tos ferina (tos convulsiva), meningitis y poliomielitis. Muchas de estas infecciones pueden causar enfermedades serias o potencialmente mortales y pueden llevar a discapacidades de por vida.